Teilprojekte: A1 bis A4

Hier in Projektbereich A wird sich neuen Ansätzen zur Kodierung und Dekodierung langzeitgespeicherter Informationen in molekularen Speichern gewidmet. Der Schwerpunkt liegt dabei auf neuen Kodierungen, Indexstrukturen und Speicherhierarchien.

Bei seiner Entwicklung und Evaluation von höherwertigen Kodierungen baut das Projekt A1 (Heider) auf langjähriger Erfahrung im Bereich der DNA-Kodierung, DNA-Kryptographie und DNA-Steganographie. Genauer werden neue Kodierungen für die molekulare Langzeit-Speicherung entwickelt, sowie die Auswertung von NGS-Daten bioinformatisch unterstützt. Hierfür sind Zusammenarbeiten mit Gruppen der Projektbereiche A, B und C geplant.

Die Entwicklung einer benutzerfreundlichen Webplattform zur automatischen Analyse und Visualisierung von chemischen Cluster-Speichern findet im Projekt A2 statt. Die Arbeiten werden von der Nachwuchsgruppe unter Dr. Georges Hattab durchgeführt. Geplant ist dabei neben Zusammenarbeiten innerhalb des eigenen Projektbereichs auch eine Zusammenarbeit mit dem Bereich C.

Das Projekt A3 (Freisleben) beschäftigt sich mit binären Kodierungsschemata für DNA-Speicher mit anpassbaren Fehlererkennungs- und -korrektureigenschaften, der Konzeption und Implementierung von Primern zur effizienten Partitionierung und Assemblierung von DNA-Strängen, sowie der Analyse der Leistungskriterien von DNA-Speichern und der in MOSLA konzipierten neuen molekularen Speicherhierarchie. Hierbei findet im Rahmen der Kodierung und Indexierung eine Zusammenarbeit mit allen Gruppen aus dem Projektbereich A statt. Für Simulationen und experimentelle Analysen wird außerdem mit Gruppen aus den Bereichen B und C kooperiert.

Der Indexierung in molekularen Speichern widmet sich im Projekt A4 das Team um Prof. Dr. Seeger. Hier gilt es, unter Berücksichtigung der spezifischen Eigenschaften der DNA einen effizienten Zugang zu Teilmengen (random access) zu ermöglichen. Neben der Zusammenarbeit im Projektbereich A soll hier auch eine Zusammenarbeit mit Projektbereich B und C erfolgen.